Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL3P19876 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL3P19876 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CXCL3P19876 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms