Protein–RNA interactions for Protein: P16298

PPP3CB, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CBP16298 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP3CBP16298 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP3CBP16298 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP3CBP16298 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP3CBP16298 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP3CBP16298 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CBP16298 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CBP16298 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CBP16298 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CBP16298 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CBP16298 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CBP16298 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CBP16298 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CBP16298 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CBP16298 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CBP16298 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CBP16298 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPP3CBP16298 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPP3CBP16298 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP3CBP16298 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPP3CBP16298 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP3CBP16298 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms