Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CD46P15529 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD46P15529 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD46P15529 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD46P15529 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD46P15529 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD46P15529 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD46P15529 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CD46P15529 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD46P15529 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD46P15529 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD46P15529 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD46P15529 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD46P15529 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD46P15529 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD46P15529 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD46P15529 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD46P15529 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD46P15529 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD46P15529 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD46P15529 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD46P15529 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD46P15529 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD46P15529 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD46P15529 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD46P15529 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD46P15529 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD46P15529 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD46P15529 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD46P15529 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD46P15529 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD46P15529 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD46P15529 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD46P15529 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD46P15529 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD46P15529 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD46P15529 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD46P15529 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD46P15529 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD46P15529 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD46P15529 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD46P15529 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD46P15529 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD46P15529 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD46P15529 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD46P15529 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD46P15529 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD46P15529 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD46P15529 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD46P15529 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD46P15529 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD46P15529 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD46P15529 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD46P15529 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD46P15529 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CD46P15529 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD46P15529 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD46P15529 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD46P15529 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD46P15529 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD46P15529 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD46P15529 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD46P15529 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD46P15529 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD46P15529 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD46P15529 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD46P15529 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD46P15529 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD46P15529 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD46P15529 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD46P15529 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD46P15529 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD46P15529 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD46P15529 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD46P15529 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD46P15529 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD46P15529 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD46P15529 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD46P15529 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD46P15529 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD46P15529 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD46P15529 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD46P15529 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD46P15529 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD46P15529 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD46P15529 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD46P15529 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD46P15529 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD46P15529 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD46P15529 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD46P15529 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD46P15529 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CD46P15529 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD46P15529 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD46P15529 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD46P15529 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CD46P15529 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD46P15529 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD46P15529 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD46P15529 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms