Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYOD1P15172 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
MYOD1P15172 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MYOD1P15172 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MYOD1P15172 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms