Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA1P14867 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRA1P14867 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRA1P14867 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA1P14867 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA1P14867 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRA1P14867 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRA1P14867 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRA1P14867 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRA1P14867 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRA1P14867 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRA1P14867 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRA1P14867 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRA1P14867 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRA1P14867 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRA1P14867 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRA1P14867 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA1P14867 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRA1P14867 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRA1P14867 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRA1P14867 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRA1P14867 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRA1P14867 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA1P14867 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA1P14867 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA1P14867 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA1P14867 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRA1P14867 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRA1P14867 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRA1P14867 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRA1P14867 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRA1P14867 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRA1P14867 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRA1P14867 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRA1P14867 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABRA1P14867 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GABRA1P14867 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRA1P14867 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRA1P14867 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms