Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-EP13747 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-EP13747 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-EP13747 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-EP13747 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-EP13747 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-EP13747 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-EP13747 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-EP13747 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-EP13747 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-EP13747 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-EP13747 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-EP13747 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-EP13747 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-EP13747 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-EP13747 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-EP13747 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-EP13747 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-EP13747 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-EP13747 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HLA-EP13747 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HLA-EP13747 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-EP13747 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-EP13747 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-EP13747 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-EP13747 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-EP13747 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-EP13747 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-EP13747 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-EP13747 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-EP13747 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-EP13747 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-EP13747 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-EP13747 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-EP13747 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-EP13747 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-EP13747 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-EP13747 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-EP13747 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-EP13747 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 402 ms