Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG2P13727 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG2P13727 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG2P13727 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG2P13727 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG2P13727 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG2P13727 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG2P13727 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG2P13727 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG2P13727 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG2P13727 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG2P13727 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG2P13727 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG2P13727 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG2P13727 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG2P13727 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG2P13727 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG2P13727 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG2P13727 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG2P13727 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG2P13727 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRG2P13727 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG2P13727 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG2P13727 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG2P13727 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG2P13727 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG2P13727 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG2P13727 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG2P13727 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG2P13727 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG2P13727 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG2P13727 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG2P13727 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG2P13727 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG2P13727 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG2P13727 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG2P13727 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG2P13727 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG2P13727 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG2P13727 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG2P13727 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG2P13727 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG2P13727 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG2P13727 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG2P13727 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG2P13727 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG2P13727 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG2P13727 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG2P13727 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG2P13727 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG2P13727 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG2P13727 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG2P13727 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG2P13727 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG2P13727 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG2P13727 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG2P13727 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG2P13727 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG2P13727 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG2P13727 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG2P13727 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG2P13727 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG2P13727 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG2P13727 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG2P13727 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG2P13727 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRG2P13727 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG2P13727 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG2P13727 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG2P13727 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG2P13727 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG2P13727 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG2P13727 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG2P13727 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG2P13727 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG2P13727 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG2P13727 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG2P13727 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG2P13727 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG2P13727 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG2P13727 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG2P13727 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG2P13727 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG2P13727 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG2P13727 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG2P13727 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG2P13727 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG2P13727 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG2P13727 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG2P13727 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG2P13727 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG2P13727 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG2P13727 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG2P13727 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG2P13727 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG2P13727 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG2P13727 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG2P13727 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG2P13727 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG2P13727 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms