Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH1P12830 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH1P12830 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH1P12830 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH1P12830 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH1P12830 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH1P12830 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH1P12830 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH1P12830 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH1P12830 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH1P12830 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH1P12830 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH1P12830 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH1P12830 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH1P12830 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH1P12830 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH1P12830 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH1P12830 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH1P12830 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH1P12830 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH1P12830 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH1P12830 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH1P12830 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH1P12830 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH1P12830 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH1P12830 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDH1P12830 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH1P12830 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH1P12830 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH1P12830 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH1P12830 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH1P12830 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH1P12830 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH1P12830 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH1P12830 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH1P12830 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH1P12830 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH1P12830 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH1P12830 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH1P12830 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH1P12830 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH1P12830 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH1P12830 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH1P12830 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH1P12830 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH1P12830 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH1P12830 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH1P12830 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH1P12830 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH1P12830 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH1P12830 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH1P12830 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH1P12830 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH1P12830 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH1P12830 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH1P12830 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH1P12830 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH1P12830 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH1P12830 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH1P12830 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH1P12830 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH1P12830 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH1P12830 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH1P12830 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH1P12830 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH1P12830 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH1P12830 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH1P12830 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH1P12830 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH1P12830 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH1P12830 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH1P12830 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH1P12830 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH1P12830 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH1P12830 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH1P12830 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH1P12830 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH1P12830 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH1P12830 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH1P12830 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH1P12830 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH1P12830 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH1P12830 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH1P12830 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH1P12830 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH1P12830 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH1P12830 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH1P12830 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH1P12830 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH1P12830 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH1P12830 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH1P12830 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH1P12830 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDH1P12830 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH1P12830 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH1P12830 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH1P12830 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH1P12830 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH1P12830 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH1P12830 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms