Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMP4P12644 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP4P12644 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP4P12644 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP4P12644 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP4P12644 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP4P12644 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP4P12644 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BMP4P12644 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMP4P12644 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BMP4P12644 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP4P12644 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP4P12644 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP4P12644 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP4P12644 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP4P12644 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP4P12644 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BMP4P12644 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BMP4P12644 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP4P12644 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP4P12644 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP4P12644 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP4P12644 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP4P12644 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMP4P12644 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP4P12644 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP4P12644 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP4P12644 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP4P12644 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BMP4P12644 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP4P12644 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP4P12644 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP4P12644 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP4P12644 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP4P12644 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BMP4P12644 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP4P12644 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP4P12644 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BMP4P12644 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP4P12644 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP4P12644 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP4P12644 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMP4P12644 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP4P12644 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP4P12644 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP4P12644 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP4P12644 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP4P12644 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP4P12644 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP4P12644 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP4P12644 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP4P12644 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP4P12644 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BMP4P12644 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP4P12644 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP4P12644 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP4P12644 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP4P12644 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP4P12644 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BMP4P12644 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BMP4P12644 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BMP4P12644 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP4P12644 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP4P12644 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP4P12644 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP4P12644 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP4P12644 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMP4P12644 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMP4P12644 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP4P12644 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BMP4P12644 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP4P12644 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP4P12644 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP4P12644 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMP4P12644 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP4P12644 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP4P12644 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP4P12644 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BMP4P12644 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP4P12644 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BMP4P12644 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BMP4P12644 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BMP4P12644 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP4P12644 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP4P12644 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP4P12644 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BMP4P12644 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP4P12644 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BMP4P12644 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP4P12644 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP4P12644 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP4P12644 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP4P12644 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP4P12644 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMP4P12644 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP4P12644 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP4P12644 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP4P12644 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMP4P12644 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMP4P12644 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms