Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RARAP10276 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RARAP10276 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RARAP10276 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RARAP10276 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RARAP10276 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARAP10276 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARAP10276 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RARAP10276 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RARAP10276 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RARAP10276 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RARAP10276 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RARAP10276 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RARAP10276 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RARAP10276 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RARAP10276 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RARAP10276 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RARAP10276 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARAP10276 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARAP10276 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARAP10276 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARAP10276 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARAP10276 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARAP10276 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARAP10276 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARAP10276 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RARAP10276 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARAP10276 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARAP10276 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARAP10276 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARAP10276 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARAP10276 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARAP10276 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARAP10276 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARAP10276 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARAP10276 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARAP10276 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARAP10276 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARAP10276 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARAP10276 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARAP10276 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARAP10276 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARAP10276 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARAP10276 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARAP10276 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARAP10276 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARAP10276 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARAP10276 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARAP10276 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARAP10276 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RARAP10276 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RARAP10276 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RARAP10276 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARAP10276 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARAP10276 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARAP10276 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARAP10276 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARAP10276 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARAP10276 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARAP10276 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARAP10276 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARAP10276 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RARAP10276 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RARAP10276 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RARAP10276 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RARAP10276 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RARAP10276 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RARAP10276 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RARAP10276 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RARAP10276 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RARAP10276 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RARAP10276 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RARAP10276 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARAP10276 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARAP10276 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RARAP10276 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
RARAP10276 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RARAP10276 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RARAP10276 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RARAP10276 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RARAP10276 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RARAP10276 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RARAP10276 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RARAP10276 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RARAP10276 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RARAP10276 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RARAP10276 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RARAP10276 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RARAP10276 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RARAP10276 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RARAP10276 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RARAP10276 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RARAP10276 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARAP10276 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARAP10276 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARAP10276 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RARAP10276 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RARAP10276 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RARAP10276 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RARAP10276 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms