Protein–RNA interactions for Protein: P0CB38

PABPC4L, Polyadenylate-binding protein 4-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4LP0CB38 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC4LP0CB38 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC4LP0CB38 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC4LP0CB38 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PABPC4LP0CB38 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms