Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRR29P0C7W0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRR29P0C7W0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRR29P0C7W0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRR29P0C7W0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRR29P0C7W0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRR29P0C7W0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRR29P0C7W0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRR29P0C7W0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRR29P0C7W0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRR29P0C7W0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRR29P0C7W0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRR29P0C7W0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRR29P0C7W0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PRR29P0C7W0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRR29P0C7W0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRR29P0C7W0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PRR29P0C7W0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRR29P0C7W0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRR29P0C7W0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRR29P0C7W0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRR29P0C7W0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRR29P0C7W0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRR29P0C7W0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRR29P0C7W0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PRR29P0C7W0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRR29P0C7W0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRR29P0C7W0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRR29P0C7W0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRR29P0C7W0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms