Protein–RNA interactions for Protein: P0C091

FREM3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM3P0C091 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FREM3P0C091 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FREM3P0C091 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FREM3P0C091 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FREM3P0C091 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FREM3P0C091 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FREM3P0C091 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FREM3P0C091 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FREM3P0C091 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FREM3P0C091 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FREM3P0C091 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FREM3P0C091 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FREM3P0C091 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FREM3P0C091 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FREM3P0C091 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FREM3P0C091 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FREM3P0C091 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FREM3P0C091 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FREM3P0C091 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FREM3P0C091 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms