Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD63P08962 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CD63P08962 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD63P08962 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD63P08962 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD63P08962 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD63P08962 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD63P08962 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD63P08962 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CD63P08962 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD63P08962 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD63P08962 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD63P08962 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD63P08962 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD63P08962 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD63P08962 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD63P08962 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD63P08962 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD63P08962 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD63P08962 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD63P08962 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD63P08962 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD63P08962 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD63P08962 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD63P08962 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD63P08962 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD63P08962 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD63P08962 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD63P08962 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD63P08962 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD63P08962 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD63P08962 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD63P08962 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CD63P08962 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD63P08962 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CD63P08962 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD63P08962 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD63P08962 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD63P08962 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD63P08962 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD63P08962 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD63P08962 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD63P08962 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD63P08962 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD63P08962 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD63P08962 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD63P08962 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD63P08962 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD63P08962 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD63P08962 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD63P08962 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD63P08962 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD63P08962 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD63P08962 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD63P08962 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD63P08962 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD63P08962 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CD63P08962 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD63P08962 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD63P08962 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CD63P08962 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD63P08962 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD63P08962 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CD63P08962 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CD63P08962 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD63P08962 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CD63P08962 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD63P08962 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CD63P08962 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CD63P08962 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD63P08962 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD63P08962 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD63P08962 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CD63P08962 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD63P08962 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD63P08962 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD63P08962 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD63P08962 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD63P08962 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD63P08962 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD63P08962 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD63P08962 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD63P08962 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD63P08962 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD63P08962 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD63P08962 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD63P08962 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD63P08962 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD63P08962 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD63P08962 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CD63P08962 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CD63P08962 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD63P08962 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD63P08962 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD63P08962 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD63P08962 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD63P08962 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD63P08962 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CD63P08962 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD63P08962 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms