Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms