Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOP08100 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOP08100 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOP08100 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOP08100 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOP08100 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOP08100 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOP08100 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOP08100 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RHOP08100 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHOP08100 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHOP08100 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHOP08100 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHOP08100 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOP08100 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOP08100 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOP08100 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOP08100 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOP08100 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RHOP08100 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RHOP08100 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOP08100 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOP08100 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOP08100 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOP08100 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOP08100 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOP08100 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOP08100 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOP08100 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOP08100 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOP08100 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOP08100 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RHOP08100 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RHOP08100 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOP08100 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOP08100 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOP08100 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOP08100 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOP08100 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOP08100 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOP08100 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOP08100 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOP08100 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOP08100 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOP08100 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHOP08100 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHOP08100 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOP08100 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOP08100 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOP08100 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOP08100 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOP08100 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOP08100 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOP08100 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOP08100 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOP08100 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHOP08100 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHOP08100 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHOP08100 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOP08100 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RHOP08100 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOP08100 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOP08100 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOP08100 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHOP08100 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHOP08100 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHOP08100 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHOP08100 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHOP08100 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHOP08100 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOP08100 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOP08100 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOP08100 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOP08100 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHOP08100 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHOP08100 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHOP08100 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHOP08100 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHOP08100 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOP08100 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOP08100 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOP08100 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOP08100 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOP08100 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHOP08100 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOP08100 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOP08100 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOP08100 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOP08100 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOP08100 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOP08100 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOP08100 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOP08100 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOP08100 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOP08100 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOP08100 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOP08100 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOP08100 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOP08100 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOP08100 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms