Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NEFLP07196 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NEFLP07196 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
NEFLP07196 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
NEFLP07196 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NEFLP07196 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NEFLP07196 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NEFLP07196 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NEFLP07196 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NEFLP07196 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NEFLP07196 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NEFLP07196 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NEFLP07196 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NEFLP07196 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NEFLP07196 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NEFLP07196 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NEFLP07196 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
NEFLP07196 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NEFLP07196 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NEFLP07196 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NEFLP07196 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NEFLP07196 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
NEFLP07196 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NEFLP07196 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NEFLP07196 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NEFLP07196 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NEFLP07196 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NEFLP07196 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NEFLP07196 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NEFLP07196 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NEFLP07196 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NEFLP07196 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NEFLP07196 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NEFLP07196 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
NEFLP07196 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NEFLP07196 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NEFLP07196 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NEFLP07196 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NEFLP07196 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NEFLP07196 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEFLP07196 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEFLP07196 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NEFLP07196 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NEFLP07196 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NEFLP07196 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NEFLP07196 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NEFLP07196 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NEFLP07196 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NEFLP07196 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NEFLP07196 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NEFLP07196 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NEFLP07196 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NEFLP07196 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NEFLP07196 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NEFLP07196 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NEFLP07196 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NEFLP07196 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NEFLP07196 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
NEFLP07196 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NEFLP07196 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NEFLP07196 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NEFLP07196 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NEFLP07196 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
NEFLP07196 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
NEFLP07196 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NEFLP07196 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NEFLP07196 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NEFLP07196 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NEFLP07196 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NEFLP07196 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NEFLP07196 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NEFLP07196 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NEFLP07196 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NEFLP07196 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NEFLP07196 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NEFLP07196 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NEFLP07196 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NEFLP07196 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NEFLP07196 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NEFLP07196 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NEFLP07196 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NEFLP07196 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NEFLP07196 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NEFLP07196 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NEFLP07196 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NEFLP07196 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NEFLP07196 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NEFLP07196 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NEFLP07196 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NEFLP07196 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NEFLP07196 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NEFLP07196 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NEFLP07196 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
NEFLP07196 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NEFLP07196 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NEFLP07196 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NEFLP07196 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NEFLP07196 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NEFLP07196 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NEFLP07196 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms