Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC1P02654 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC1P02654 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC1P02654 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC1P02654 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC1P02654 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC1P02654 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC1P02654 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOC1P02654 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC1P02654 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC1P02654 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOC1P02654 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC1P02654 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC1P02654 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC1P02654 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC1P02654 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC1P02654 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC1P02654 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOC1P02654 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC1P02654 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC1P02654 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC1P02654 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC1P02654 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOC1P02654 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC1P02654 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOC1P02654 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC1P02654 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC1P02654 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC1P02654 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC1P02654 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC1P02654 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC1P02654 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC1P02654 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC1P02654 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC1P02654 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC1P02654 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC1P02654 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC1P02654 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC1P02654 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC1P02654 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC1P02654 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC1P02654 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC1P02654 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC1P02654 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC1P02654 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC1P02654 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC1P02654 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOC1P02654 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOC1P02654 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOC1P02654 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOC1P02654 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC1P02654 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC1P02654 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC1P02654 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC1P02654 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC1P02654 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC1P02654 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC1P02654 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC1P02654 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC1P02654 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC1P02654 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOC1P02654 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOC1P02654 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOC1P02654 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOC1P02654 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC1P02654 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC1P02654 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC1P02654 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC1P02654 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC1P02654 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC1P02654 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC1P02654 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC1P02654 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC1P02654 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC1P02654 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC1P02654 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOC1P02654 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOC1P02654 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOC1P02654 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOC1P02654 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOC1P02654 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOC1P02654 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOC1P02654 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC1P02654 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC1P02654 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC1P02654 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC1P02654 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC1P02654 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC1P02654 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC1P02654 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC1P02654 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC1P02654 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC1P02654 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC1P02654 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC1P02654 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC1P02654 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOC1P02654 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOC1P02654 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOC1P02654 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOC1P02654 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms