Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NSD2O96028 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NSD2O96028 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NSD2O96028 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NSD2O96028 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NSD2O96028 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NSD2O96028 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NSD2O96028 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NSD2O96028 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
NSD2O96028 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NSD2O96028 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NSD2O96028 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NSD2O96028 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NSD2O96028 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NSD2O96028 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NSD2O96028 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NSD2O96028 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NSD2O96028 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
NSD2O96028 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NSD2O96028 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NSD2O96028 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NSD2O96028 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NSD2O96028 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NSD2O96028 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NSD2O96028 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NSD2O96028 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NSD2O96028 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NSD2O96028 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NSD2O96028 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NSD2O96028 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NSD2O96028 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NSD2O96028 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NSD2O96028 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NSD2O96028 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NSD2O96028 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NSD2O96028 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NSD2O96028 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NSD2O96028 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NSD2O96028 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
NSD2O96028 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NSD2O96028 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NSD2O96028 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NSD2O96028 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NSD2O96028 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NSD2O96028 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NSD2O96028 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NSD2O96028 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NSD2O96028 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NSD2O96028 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NSD2O96028 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NSD2O96028 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NSD2O96028 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NSD2O96028 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NSD2O96028 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NSD2O96028 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NSD2O96028 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
NSD2O96028 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NSD2O96028 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NSD2O96028 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NSD2O96028 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NSD2O96028 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NSD2O96028 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NSD2O96028 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NSD2O96028 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NSD2O96028 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NSD2O96028 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
NSD2O96028 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NSD2O96028 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NSD2O96028 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NSD2O96028 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NSD2O96028 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NSD2O96028 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NSD2O96028 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NSD2O96028 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NSD2O96028 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NSD2O96028 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NSD2O96028 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NSD2O96028 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NSD2O96028 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NSD2O96028 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
NSD2O96028 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NSD2O96028 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
NSD2O96028 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NSD2O96028 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NSD2O96028 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NSD2O96028 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NSD2O96028 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NSD2O96028 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NSD2O96028 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NSD2O96028 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NSD2O96028 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NSD2O96028 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NSD2O96028 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NSD2O96028 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NSD2O96028 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NSD2O96028 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NSD2O96028 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NSD2O96028 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NSD2O96028 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NSD2O96028 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms