Protein–RNA interactions for Protein: O95876

WDPCP, WD repeat-containing and planar cell polarity effector protein fritz homolog, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDPCPO95876 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDPCPO95876 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
WDPCPO95876 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDPCPO95876 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDPCPO95876 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDPCPO95876 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDPCPO95876 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDPCPO95876 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDPCPO95876 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDPCPO95876 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDPCPO95876 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDPCPO95876 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDPCPO95876 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDPCPO95876 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDPCPO95876 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDPCPO95876 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDPCPO95876 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDPCPO95876 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDPCPO95876 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDPCPO95876 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDPCPO95876 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDPCPO95876 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDPCPO95876 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDPCPO95876 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms