Protein–RNA interactions for Protein: O95872

GPANK1, G patch domain and ankyrin repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPANK1O95872 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPANK1O95872 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPANK1O95872 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPANK1O95872 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPANK1O95872 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPANK1O95872 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPANK1O95872 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPANK1O95872 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPANK1O95872 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GPANK1O95872 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPANK1O95872 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPANK1O95872 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPANK1O95872 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPANK1O95872 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPANK1O95872 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPANK1O95872 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPANK1O95872 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPANK1O95872 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPANK1O95872 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPANK1O95872 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPANK1O95872 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPANK1O95872 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPANK1O95872 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms