Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SVILO95425 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SVILO95425 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SVILO95425 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SVILO95425 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SVILO95425 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SVILO95425 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SVILO95425 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SVILO95425 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SVILO95425 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SVILO95425 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SVILO95425 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SVILO95425 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SVILO95425 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SVILO95425 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SVILO95425 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SVILO95425 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SVILO95425 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SVILO95425 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SVILO95425 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SVILO95425 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SVILO95425 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SVILO95425 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SVILO95425 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SVILO95425 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SVILO95425 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SVILO95425 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SVILO95425 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SVILO95425 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SVILO95425 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SVILO95425 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SVILO95425 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SVILO95425 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SVILO95425 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SVILO95425 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SVILO95425 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SVILO95425 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SVILO95425 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SVILO95425 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SVILO95425 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SVILO95425 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SVILO95425 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SVILO95425 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SVILO95425 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SVILO95425 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SVILO95425 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SVILO95425 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SVILO95425 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SVILO95425 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SVILO95425 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SVILO95425 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SVILO95425 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SVILO95425 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SVILO95425 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SVILO95425 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SVILO95425 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SVILO95425 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SVILO95425 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SVILO95425 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SVILO95425 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SVILO95425 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SVILO95425 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SVILO95425 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SVILO95425 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SVILO95425 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SVILO95425 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SVILO95425 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SVILO95425 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SVILO95425 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SVILO95425 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SVILO95425 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SVILO95425 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SVILO95425 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SVILO95425 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SVILO95425 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SVILO95425 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SVILO95425 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SVILO95425 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SVILO95425 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SVILO95425 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SVILO95425 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SVILO95425 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SVILO95425 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SVILO95425 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SVILO95425 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SVILO95425 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SVILO95425 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SVILO95425 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SVILO95425 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SVILO95425 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SVILO95425 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SVILO95425 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SVILO95425 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SVILO95425 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SVILO95425 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SVILO95425 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SVILO95425 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SVILO95425 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SVILO95425 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SVILO95425 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms