Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYPD3O95274 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYPD3O95274 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYPD3O95274 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYPD3O95274 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYPD3O95274 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYPD3O95274 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LYPD3O95274 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYPD3O95274 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LYPD3O95274 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LYPD3O95274 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LYPD3O95274 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYPD3O95274 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYPD3O95274 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYPD3O95274 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LYPD3O95274 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYPD3O95274 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYPD3O95274 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYPD3O95274 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LYPD3O95274 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms