Protein–RNA interactions for Protein: O95150

TNFSF15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF15O95150 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF15O95150 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF15O95150 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF15O95150 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF15O95150 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFSF15O95150 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF15O95150 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF15O95150 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF15O95150 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF15O95150 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF15O95150 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF15O95150 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF15O95150 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF15O95150 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF15O95150 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF15O95150 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF15O95150 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF15O95150 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFSF15O95150 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF15O95150 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF15O95150 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF15O95150 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF15O95150 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF15O95150 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF15O95150 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF15O95150 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF15O95150 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF15O95150 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF15O95150 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF15O95150 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF15O95150 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF15O95150 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFSF15O95150 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFSF15O95150 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF15O95150 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF15O95150 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF15O95150 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF15O95150 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF15O95150 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF15O95150 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF15O95150 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF15O95150 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF15O95150 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF15O95150 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF15O95150 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF15O95150 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF15O95150 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF15O95150 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF15O95150 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF15O95150 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF15O95150 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFSF15O95150 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFSF15O95150 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF15O95150 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFSF15O95150 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF15O95150 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF15O95150 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF15O95150 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF15O95150 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms