Protein–RNA interactions for Protein: O75841

UPK1B, Uroplakin-1b, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1BO75841 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPK1BO75841 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPK1BO75841 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPK1BO75841 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPK1BO75841 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPK1BO75841 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPK1BO75841 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPK1BO75841 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPK1BO75841 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPK1BO75841 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPK1BO75841 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPK1BO75841 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPK1BO75841 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPK1BO75841 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPK1BO75841 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPK1BO75841 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPK1BO75841 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPK1BO75841 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UPK1BO75841 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPK1BO75841 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK1BO75841 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms