Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EIF3JO75822 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EIF3JO75822 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EIF3JO75822 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EIF3JO75822 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EIF3JO75822 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EIF3JO75822 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EIF3JO75822 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EIF3JO75822 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EIF3JO75822 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EIF3JO75822 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EIF3JO75822 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EIF3JO75822 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EIF3JO75822 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EIF3JO75822 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
EIF3JO75822 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EIF3JO75822 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EIF3JO75822 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EIF3JO75822 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EIF3JO75822 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EIF3JO75822 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EIF3JO75822 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EIF3JO75822 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EIF3JO75822 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EIF3JO75822 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EIF3JO75822 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EIF3JO75822 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
EIF3JO75822 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EIF3JO75822 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EIF3JO75822 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EIF3JO75822 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
EIF3JO75822 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EIF3JO75822 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EIF3JO75822 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EIF3JO75822 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EIF3JO75822 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EIF3JO75822 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
EIF3JO75822 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EIF3JO75822 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EIF3JO75822 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EIF3JO75822 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EIF3JO75822 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EIF3JO75822 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EIF3JO75822 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
EIF3JO75822 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EIF3JO75822 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF3JO75822 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms