Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCATO75600 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCATO75600 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCATO75600 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCATO75600 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCATO75600 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCATO75600 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCATO75600 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCATO75600 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCATO75600 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCATO75600 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCATO75600 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCATO75600 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCATO75600 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCATO75600 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCATO75600 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCATO75600 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCATO75600 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCATO75600 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCATO75600 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCATO75600 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCATO75600 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCATO75600 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCATO75600 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCATO75600 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCATO75600 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCATO75600 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCATO75600 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCATO75600 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCATO75600 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GCATO75600 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCATO75600 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCATO75600 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCATO75600 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCATO75600 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCATO75600 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCATO75600 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCATO75600 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCATO75600 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCATO75600 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCATO75600 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCATO75600 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCATO75600 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GCATO75600 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCATO75600 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCATO75600 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCATO75600 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCATO75600 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCATO75600 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCATO75600 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCATO75600 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCATO75600 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCATO75600 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCATO75600 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCATO75600 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCATO75600 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCATO75600 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCATO75600 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCATO75600 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GCATO75600 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GCATO75600 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCATO75600 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCATO75600 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCATO75600 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GCATO75600 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCATO75600 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCATO75600 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCATO75600 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GCATO75600 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCATO75600 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCATO75600 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GCATO75600 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCATO75600 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCATO75600 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCATO75600 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCATO75600 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCATO75600 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCATO75600 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCATO75600 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCATO75600 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCATO75600 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCATO75600 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCATO75600 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCATO75600 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCATO75600 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCATO75600 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCATO75600 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCATO75600 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCATO75600 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCATO75600 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCATO75600 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCATO75600 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCATO75600 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCATO75600 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCATO75600 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GCATO75600 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCATO75600 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCATO75600 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCATO75600 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GCATO75600 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms