Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPFIA4O75335 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPFIA4O75335 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPFIA4O75335 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPFIA4O75335 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPFIA4O75335 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPFIA4O75335 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPFIA4O75335 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPFIA4O75335 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPFIA4O75335 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPFIA4O75335 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPFIA4O75335 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PPFIA4O75335 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPFIA4O75335 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPFIA4O75335 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPFIA4O75335 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPFIA4O75335 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPFIA4O75335 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPFIA4O75335 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPFIA4O75335 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPFIA4O75335 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPFIA4O75335 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPFIA4O75335 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPFIA4O75335 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PPFIA4O75335 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPFIA4O75335 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPFIA4O75335 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPFIA4O75335 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPFIA4O75335 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPFIA4O75335 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPFIA4O75335 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPFIA4O75335 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPFIA4O75335 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPFIA4O75335 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPFIA4O75335 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPFIA4O75335 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPFIA4O75335 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPFIA4O75335 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIA4O75335 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIA4O75335 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIA4O75335 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIA4O75335 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIA4O75335 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIA4O75335 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIA4O75335 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPFIA4O75335 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPFIA4O75335 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPFIA4O75335 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPFIA4O75335 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPFIA4O75335 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPFIA4O75335 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPFIA4O75335 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPFIA4O75335 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPFIA4O75335 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PPFIA4O75335 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA4O75335 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms