Protein–RNA interactions for Protein: O75083

WDR1, WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR1O75083 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR1O75083 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR1O75083 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR1O75083 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR1O75083 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDR1O75083 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR1O75083 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR1O75083 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDR1O75083 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR1O75083 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR1O75083 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR1O75083 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR1O75083 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR1O75083 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR1O75083 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR1O75083 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR1O75083 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR1O75083 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR1O75083 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR1O75083 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR1O75083 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR1O75083 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR1O75083 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR1O75083 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR1O75083 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR1O75083 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR1O75083 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR1O75083 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR1O75083 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR1O75083 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR1O75083 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR1O75083 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR1O75083 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR1O75083 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR1O75083 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR1O75083 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR1O75083 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR1O75083 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR1O75083 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR1O75083 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR1O75083 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR1O75083 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR1O75083 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR1O75083 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR1O75083 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR1O75083 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR1O75083 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR1O75083 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR1O75083 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR1O75083 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR1O75083 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR1O75083 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR1O75083 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR1O75083 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR1O75083 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR1O75083 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR1O75083 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR1O75083 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR1O75083 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR1O75083 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR1O75083 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR1O75083 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
WDR1O75083 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR1O75083 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR1O75083 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR1O75083 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR1O75083 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR1O75083 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR1O75083 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR1O75083 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR1O75083 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR1O75083 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR1O75083 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR1O75083 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR1O75083 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR1O75083 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR1O75083 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR1O75083 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR1O75083 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR1O75083 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR1O75083 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR1O75083 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR1O75083 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR1O75083 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR1O75083 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR1O75083 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR1O75083 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR1O75083 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR1O75083 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR1O75083 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR1O75083 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR1O75083 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR1O75083 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR1O75083 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR1O75083 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR1O75083 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR1O75083 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR1O75083 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR1O75083 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR1O75083 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms