Protein–RNA interactions for Protein: O75030

MITF, Microphthalmia-associated transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITFO75030 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MITFO75030 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MITFO75030 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MITFO75030 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MITFO75030 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MITFO75030 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MITFO75030 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MITFO75030 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MITFO75030 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MITFO75030 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MITFO75030 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MITFO75030 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MITFO75030 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MITFO75030 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MITFO75030 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MITFO75030 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MITFO75030 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MITFO75030 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MITFO75030 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MITFO75030 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MITFO75030 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MITFO75030 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MITFO75030 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MITFO75030 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MITFO75030 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MITFO75030 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MITFO75030 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MITFO75030 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MITFO75030 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MITFO75030 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MITFO75030 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MITFO75030 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MITFO75030 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MITFO75030 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MITFO75030 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MITFO75030 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MITFO75030 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MITFO75030 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MITFO75030 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MITFO75030 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MITFO75030 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MITFO75030 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MITFO75030 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MITFO75030 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MITFO75030 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MITFO75030 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MITFO75030 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MITFO75030 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MITFO75030 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MITFO75030 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MITFO75030 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MITFO75030 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MITFO75030 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MITFO75030 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MITFO75030 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MITFO75030 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MITFO75030 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MITFO75030 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MITFO75030 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MITFO75030 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MITFO75030 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MITFO75030 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MITFO75030 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MITFO75030 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MITFO75030 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MITFO75030 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MITFO75030 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MITFO75030 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MITFO75030 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MITFO75030 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MITFO75030 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MITFO75030 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MITFO75030 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MITFO75030 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MITFO75030 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MITFO75030 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MITFO75030 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MITFO75030 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MITFO75030 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MITFO75030 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MITFO75030 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MITFO75030 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MITFO75030 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MITFO75030 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MITFO75030 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MITFO75030 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MITFO75030 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MITFO75030 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MITFO75030 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MITFO75030 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MITFO75030 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MITFO75030 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MITFO75030 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MITFO75030 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MITFO75030 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MITFO75030 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MITFO75030 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MITFO75030 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MITFO75030 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MITFO75030 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms