Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KERAO60938 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KERAO60938 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KERAO60938 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KERAO60938 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KERAO60938 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KERAO60938 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KERAO60938 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KERAO60938 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KERAO60938 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KERAO60938 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KERAO60938 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KERAO60938 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KERAO60938 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
KERAO60938 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KERAO60938 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KERAO60938 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KERAO60938 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KERAO60938 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KERAO60938 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KERAO60938 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KERAO60938 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KERAO60938 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KERAO60938 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KERAO60938 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KERAO60938 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KERAO60938 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KERAO60938 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KERAO60938 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KERAO60938 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KERAO60938 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KERAO60938 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KERAO60938 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KERAO60938 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KERAO60938 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KERAO60938 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KERAO60938 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KERAO60938 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KERAO60938 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KERAO60938 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KERAO60938 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KERAO60938 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KERAO60938 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KERAO60938 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KERAO60938 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KERAO60938 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KERAO60938 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KERAO60938 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KERAO60938 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KERAO60938 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KERAO60938 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KERAO60938 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KERAO60938 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KERAO60938 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KERAO60938 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KERAO60938 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KERAO60938 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KERAO60938 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KERAO60938 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KERAO60938 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KERAO60938 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KERAO60938 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KERAO60938 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KERAO60938 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KERAO60938 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KERAO60938 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KERAO60938 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KERAO60938 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KERAO60938 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KERAO60938 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KERAO60938 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KERAO60938 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KERAO60938 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
KERAO60938 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KERAO60938 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KERAO60938 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KERAO60938 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KERAO60938 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KERAO60938 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KERAO60938 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KERAO60938 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KERAO60938 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KERAO60938 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KERAO60938 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KERAO60938 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KERAO60938 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KERAO60938 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KERAO60938 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KERAO60938 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KERAO60938 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KERAO60938 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KERAO60938 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KERAO60938 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KERAO60938 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KERAO60938 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KERAO60938 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KERAO60938 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KERAO60938 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KERAO60938 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KERAO60938 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms