Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF2O60811 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF2O60811 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF2O60811 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF2O60811 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF2O60811 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms