Protein–RNA interactions for Protein: O60711

LPXN, Leupaxin, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPXNO60711 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LPXNO60711 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LPXNO60711 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LPXNO60711 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LPXNO60711 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LPXNO60711 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LPXNO60711 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LPXNO60711 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LPXNO60711 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LPXNO60711 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LPXNO60711 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LPXNO60711 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LPXNO60711 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LPXNO60711 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LPXNO60711 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LPXNO60711 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LPXNO60711 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LPXNO60711 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LPXNO60711 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LPXNO60711 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LPXNO60711 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LPXNO60711 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LPXNO60711 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LPXNO60711 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LPXNO60711 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LPXNO60711 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LPXNO60711 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LPXNO60711 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LPXNO60711 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LPXNO60711 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LPXNO60711 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LPXNO60711 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LPXNO60711 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LPXNO60711 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LPXNO60711 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LPXNO60711 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LPXNO60711 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LPXNO60711 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LPXNO60711 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LPXNO60711 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LPXNO60711 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LPXNO60711 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LPXNO60711 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LPXNO60711 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LPXNO60711 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LPXNO60711 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LPXNO60711 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LPXNO60711 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LPXNO60711 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LPXNO60711 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LPXNO60711 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LPXNO60711 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LPXNO60711 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LPXNO60711 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LPXNO60711 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LPXNO60711 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LPXNO60711 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LPXNO60711 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LPXNO60711 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LPXNO60711 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LPXNO60711 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LPXNO60711 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LPXNO60711 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LPXNO60711 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LPXNO60711 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LPXNO60711 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LPXNO60711 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LPXNO60711 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LPXNO60711 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LPXNO60711 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LPXNO60711 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LPXNO60711 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LPXNO60711 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LPXNO60711 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LPXNO60711 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LPXNO60711 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LPXNO60711 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LPXNO60711 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LPXNO60711 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LPXNO60711 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LPXNO60711 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LPXNO60711 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LPXNO60711 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LPXNO60711 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LPXNO60711 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LPXNO60711 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LPXNO60711 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LPXNO60711 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LPXNO60711 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LPXNO60711 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LPXNO60711 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LPXNO60711 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LPXNO60711 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LPXNO60711 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LPXNO60711 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LPXNO60711 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LPXNO60711 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LPXNO60711 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LPXNO60711 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LPXNO60711 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms