Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GFRA3O60609 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GFRA3O60609 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GFRA3O60609 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GFRA3O60609 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GFRA3O60609 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GFRA3O60609 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GFRA3O60609 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GFRA3O60609 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms