Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOBOXO60393 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOBOXO60393 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOBOXO60393 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOBOXO60393 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOBOXO60393 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NOBOXO60393 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOBOXO60393 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NOBOXO60393 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOBOXO60393 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOBOXO60393 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOBOXO60393 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOBOXO60393 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOBOXO60393 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOBOXO60393 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOBOXO60393 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NOBOXO60393 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOBOXO60393 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NOBOXO60393 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOBOXO60393 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOBOXO60393 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOBOXO60393 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOBOXO60393 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NOBOXO60393 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOBOXO60393 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOBOXO60393 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOBOXO60393 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOBOXO60393 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOBOXO60393 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOBOXO60393 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NOBOXO60393 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NOBOXO60393 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOBOXO60393 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOBOXO60393 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NOBOXO60393 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOBOXO60393 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOBOXO60393 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOBOXO60393 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOBOXO60393 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOBOXO60393 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOBOXO60393 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOBOXO60393 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOBOXO60393 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOBOXO60393 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOBOXO60393 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms