Protein–RNA interactions for Protein: O60315

ZEB2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB2O60315 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZEB2O60315 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ZEB2O60315 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZEB2O60315 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ZEB2O60315 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZEB2O60315 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZEB2O60315 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZEB2O60315 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZEB2O60315 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZEB2O60315 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZEB2O60315 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZEB2O60315 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZEB2O60315 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZEB2O60315 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZEB2O60315 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZEB2O60315 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZEB2O60315 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZEB2O60315 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZEB2O60315 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZEB2O60315 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZEB2O60315 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZEB2O60315 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ZEB2O60315 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZEB2O60315 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZEB2O60315 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZEB2O60315 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZEB2O60315 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZEB2O60315 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZEB2O60315 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZEB2O60315 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZEB2O60315 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZEB2O60315 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZEB2O60315 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZEB2O60315 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZEB2O60315 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZEB2O60315 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ZEB2O60315 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ZEB2O60315 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZEB2O60315 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZEB2O60315 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ZEB2O60315 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZEB2O60315 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZEB2O60315 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZEB2O60315 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZEB2O60315 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZEB2O60315 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZEB2O60315 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZEB2O60315 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZEB2O60315 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZEB2O60315 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZEB2O60315 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZEB2O60315 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ZEB2O60315 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZEB2O60315 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB2O60315 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZEB2O60315 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB2O60315 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB2O60315 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB2O60315 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZEB2O60315 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZEB2O60315 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZEB2O60315 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZEB2O60315 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZEB2O60315 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB2O60315 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB2O60315 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZEB2O60315 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZEB2O60315 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZEB2O60315 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB2O60315 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB2O60315 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB2O60315 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB2O60315 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB2O60315 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZEB2O60315 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZEB2O60315 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZEB2O60315 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZEB2O60315 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB2O60315 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB2O60315 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZEB2O60315 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZEB2O60315 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZEB2O60315 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ZEB2O60315 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZEB2O60315 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB2O60315 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZEB2O60315 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB2O60315 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB2O60315 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB2O60315 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB2O60315 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZEB2O60315 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ZEB2O60315 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZEB2O60315 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZEB2O60315 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB2O60315 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB2O60315 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB2O60315 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB2O60315 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB2O60315 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms