Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD51CO43502 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD51CO43502 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD51CO43502 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD51CO43502 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD51CO43502 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAD51CO43502 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD51CO43502 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD51CO43502 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD51CO43502 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAD51CO43502 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms