Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
SYNJ1O43426 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
SYNJ1O43426 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
SYNJ1O43426 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
SYNJ1O43426 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
SYNJ1O43426 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
SYNJ1O43426 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
SYNJ1O43426 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
SYNJ1O43426 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.62
SYNJ1O43426 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.62
SYNJ1O43426 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.62
SYNJ1O43426 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC43.88■■■■■ 4.61
SYNJ1O43426 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
SYNJ1O43426 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
SYNJ1O43426 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.87■■■■■ 4.61
SYNJ1O43426 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
SYNJ1O43426 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
SYNJ1O43426 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
SYNJ1O43426 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
SYNJ1O43426 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.83■■■■■ 4.61
SYNJ1O43426 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
SYNJ1O43426 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
SYNJ1O43426 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
SYNJ1O43426 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
SYNJ1O43426 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
SYNJ1O43426 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.79■■■■■ 4.6
SYNJ1O43426 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
SYNJ1O43426 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC43.79■■■■■ 4.6
SYNJ1O43426 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
SYNJ1O43426 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
SYNJ1O43426 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
SYNJ1O43426 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
SYNJ1O43426 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
SYNJ1O43426 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC43.77■■■■■ 4.6
SYNJ1O43426 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
SYNJ1O43426 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
SYNJ1O43426 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
SYNJ1O43426 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
SYNJ1O43426 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
SYNJ1O43426 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
SYNJ1O43426 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
SYNJ1O43426 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
SYNJ1O43426 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
SYNJ1O43426 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
SYNJ1O43426 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
SYNJ1O43426 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
SYNJ1O43426 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
SYNJ1O43426 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
SYNJ1O43426 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
SYNJ1O43426 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
SYNJ1O43426 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC43.7■■■■■ 4.59
SYNJ1O43426 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC43.68■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC43.65■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC43.64■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC43.63■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.58
SYNJ1O43426 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
SYNJ1O43426 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.57
SYNJ1O43426 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
SYNJ1O43426 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
SYNJ1O43426 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC43.62■■■■■ 4.57
SYNJ1O43426 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
SYNJ1O43426 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
SYNJ1O43426 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
SYNJ1O43426 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
SYNJ1O43426 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
SYNJ1O43426 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC43.57■■■■■ 4.56
SYNJ1O43426 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
SYNJ1O43426 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
SYNJ1O43426 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC43.54■■■■■ 4.56
SYNJ1O43426 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
SYNJ1O43426 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
SYNJ1O43426 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
SYNJ1O43426 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
SYNJ1O43426 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
SYNJ1O43426 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
SYNJ1O43426 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
SYNJ1O43426 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
SYNJ1O43426 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
SYNJ1O43426 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
SYNJ1O43426 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC43.5■■■■■ 4.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms