Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD3O43242 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMD3O43242 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD3O43242 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD3O43242 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD3O43242 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD3O43242 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD3O43242 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD3O43242 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD3O43242 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD3O43242 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD3O43242 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD3O43242 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD3O43242 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD3O43242 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMD3O43242 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD3O43242 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD3O43242 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD3O43242 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD3O43242 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PSMD3O43242 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD3O43242 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD3O43242 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD3O43242 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD3O43242 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD3O43242 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms