Protein–RNA interactions for Protein: O15498

YKT6, Synaptobrevin homolog YKT6, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YKT6O15498 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YKT6O15498 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YKT6O15498 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YKT6O15498 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YKT6O15498 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YKT6O15498 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YKT6O15498 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YKT6O15498 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YKT6O15498 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YKT6O15498 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
YKT6O15498 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YKT6O15498 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YKT6O15498 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YKT6O15498 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YKT6O15498 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YKT6O15498 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YKT6O15498 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
YKT6O15498 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
YKT6O15498 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
YKT6O15498 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
YKT6O15498 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
YKT6O15498 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YKT6O15498 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
YKT6O15498 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
YKT6O15498 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
YKT6O15498 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
YKT6O15498 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YKT6O15498 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YKT6O15498 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YKT6O15498 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
YKT6O15498 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YKT6O15498 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YKT6O15498 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YKT6O15498 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
YKT6O15498 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YKT6O15498 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YKT6O15498 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
YKT6O15498 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
YKT6O15498 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YKT6O15498 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YKT6O15498 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YKT6O15498 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YKT6O15498 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YKT6O15498 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YKT6O15498 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YKT6O15498 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
YKT6O15498 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YKT6O15498 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
YKT6O15498 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YKT6O15498 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YKT6O15498 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YKT6O15498 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YKT6O15498 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YKT6O15498 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YKT6O15498 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YKT6O15498 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
YKT6O15498 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YKT6O15498 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YKT6O15498 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
YKT6O15498 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YKT6O15498 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YKT6O15498 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YKT6O15498 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YKT6O15498 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YKT6O15498 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YKT6O15498 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YKT6O15498 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YKT6O15498 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YKT6O15498 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
YKT6O15498 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YKT6O15498 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YKT6O15498 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
YKT6O15498 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YKT6O15498 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YKT6O15498 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YKT6O15498 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YKT6O15498 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YKT6O15498 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YKT6O15498 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
YKT6O15498 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YKT6O15498 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
YKT6O15498 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YKT6O15498 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
YKT6O15498 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
YKT6O15498 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YKT6O15498 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YKT6O15498 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YKT6O15498 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YKT6O15498 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YKT6O15498 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YKT6O15498 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YKT6O15498 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YKT6O15498 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YKT6O15498 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YKT6O15498 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YKT6O15498 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YKT6O15498 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YKT6O15498 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YKT6O15498 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YKT6O15498 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms