Protein–RNA interactions for Protein: O15315

RAD51B, DNA repair protein RAD51 homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51BO15315 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD51BO15315 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD51BO15315 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD51BO15315 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD51BO15315 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD51BO15315 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD51BO15315 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD51BO15315 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD51BO15315 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD51BO15315 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD51BO15315 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD51BO15315 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD51BO15315 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD51BO15315 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD51BO15315 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD51BO15315 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD51BO15315 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD51BO15315 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD51BO15315 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD51BO15315 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD51BO15315 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD51BO15315 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD51BO15315 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD51BO15315 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD51BO15315 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD51BO15315 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD51BO15315 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD51BO15315 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD51BO15315 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD51BO15315 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD51BO15315 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD51BO15315 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD51BO15315 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD51BO15315 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD51BO15315 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD51BO15315 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD51BO15315 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAD51BO15315 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD51BO15315 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAD51BO15315 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD51BO15315 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD51BO15315 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAD51BO15315 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD51BO15315 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAD51BO15315 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD51BO15315 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD51BO15315 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD51BO15315 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAD51BO15315 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAD51BO15315 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms