Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PFDN6O15212 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PFDN6O15212 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PFDN6O15212 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PFDN6O15212 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PFDN6O15212 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PFDN6O15212 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PFDN6O15212 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PFDN6O15212 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PFDN6O15212 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms