Protein–RNA interactions for Protein: O15126

SCAMP1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1O15126 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAMP1O15126 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCAMP1O15126 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAMP1O15126 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAMP1O15126 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAMP1O15126 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAMP1O15126 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAMP1O15126 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAMP1O15126 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAMP1O15126 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCAMP1O15126 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCAMP1O15126 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAMP1O15126 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAMP1O15126 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAMP1O15126 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAMP1O15126 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCAMP1O15126 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCAMP1O15126 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCAMP1O15126 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAMP1O15126 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCAMP1O15126 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAMP1O15126 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAMP1O15126 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCAMP1O15126 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCAMP1O15126 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAMP1O15126 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAMP1O15126 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAMP1O15126 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAMP1O15126 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCAMP1O15126 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAMP1O15126 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCAMP1O15126 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAMP1O15126 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAMP1O15126 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAMP1O15126 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAMP1O15126 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAMP1O15126 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAMP1O15126 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAMP1O15126 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAMP1O15126 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAMP1O15126 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAMP1O15126 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAMP1O15126 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAMP1O15126 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAMP1O15126 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAMP1O15126 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAMP1O15126 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAMP1O15126 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAMP1O15126 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms