Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ARHGEF10O15013 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARHGEF10O15013 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARHGEF10O15013 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ARHGEF10O15013 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
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