Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ARHGEF10O15013 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARHGEF10O15013 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARHGEF10O15013 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ARHGEF10O15013 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.26
ARHGEF10O15013 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF10O15013 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ARHGEF10O15013 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF10O15013 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF10O15013 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
ARHGEF10O15013 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
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