Protein–RNA interactions for Protein: O14939

PLD2, Phospholipase D2, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD2O14939 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLD2O14939 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PLD2O14939 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PLD2O14939 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLD2O14939 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLD2O14939 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLD2O14939 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLD2O14939 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLD2O14939 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLD2O14939 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLD2O14939 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLD2O14939 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLD2O14939 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLD2O14939 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLD2O14939 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLD2O14939 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLD2O14939 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PLD2O14939 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLD2O14939 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLD2O14939 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLD2O14939 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLD2O14939 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLD2O14939 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PLD2O14939 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLD2O14939 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLD2O14939 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLD2O14939 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLD2O14939 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLD2O14939 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLD2O14939 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLD2O14939 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PLD2O14939 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLD2O14939 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLD2O14939 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLD2O14939 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLD2O14939 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLD2O14939 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLD2O14939 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLD2O14939 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLD2O14939 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLD2O14939 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLD2O14939 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLD2O14939 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLD2O14939 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLD2O14939 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLD2O14939 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLD2O14939 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLD2O14939 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLD2O14939 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLD2O14939 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLD2O14939 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLD2O14939 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLD2O14939 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PLD2O14939 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLD2O14939 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLD2O14939 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLD2O14939 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PLD2O14939 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLD2O14939 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLD2O14939 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLD2O14939 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLD2O14939 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PLD2O14939 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLD2O14939 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLD2O14939 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PLD2O14939 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLD2O14939 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLD2O14939 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PLD2O14939 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLD2O14939 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLD2O14939 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PLD2O14939 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PLD2O14939 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLD2O14939 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLD2O14939 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLD2O14939 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PLD2O14939 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLD2O14939 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLD2O14939 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLD2O14939 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLD2O14939 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLD2O14939 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PLD2O14939 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLD2O14939 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLD2O14939 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLD2O14939 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLD2O14939 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLD2O14939 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PLD2O14939 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLD2O14939 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PLD2O14939 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLD2O14939 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLD2O14939 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PLD2O14939 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLD2O14939 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLD2O14939 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLD2O14939 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLD2O14939 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLD2O14939 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLD2O14939 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms