Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRPO00591 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRPO00591 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRPO00591 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRPO00591 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRPO00591 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRPO00591 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRPO00591 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRPO00591 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRPO00591 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRPO00591 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRPO00591 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRPO00591 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRPO00591 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRPO00591 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABRPO00591 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRPO00591 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRPO00591 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRPO00591 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRPO00591 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRPO00591 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRPO00591 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRPO00591 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRPO00591 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRPO00591 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRPO00591 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRPO00591 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRPO00591 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRPO00591 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRPO00591 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRPO00591 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRPO00591 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRPO00591 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRPO00591 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRPO00591 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRPO00591 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRPO00591 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRPO00591 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRPO00591 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRPO00591 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRPO00591 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABRPO00591 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRPO00591 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRPO00591 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRPO00591 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRPO00591 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRPO00591 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRPO00591 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRPO00591 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRPO00591 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRPO00591 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRPO00591 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRPO00591 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRPO00591 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRPO00591 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRPO00591 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRPO00591 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRPO00591 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRPO00591 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRPO00591 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRPO00591 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRPO00591 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRPO00591 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRPO00591 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRPO00591 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRPO00591 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRPO00591 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRPO00591 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRPO00591 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRPO00591 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRPO00591 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRPO00591 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRPO00591 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRPO00591 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRPO00591 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRPO00591 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRPO00591 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRPO00591 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRPO00591 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRPO00591 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRPO00591 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRPO00591 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRPO00591 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRPO00591 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRPO00591 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRPO00591 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRPO00591 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRPO00591 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRPO00591 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRPO00591 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRPO00591 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRPO00591 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRPO00591 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRPO00591 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRPO00591 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRPO00591 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRPO00591 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRPO00591 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRPO00591 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRPO00591 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms