Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBAG9O00559 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBAG9O00559 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBAG9O00559 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBAG9O00559 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EBAG9O00559 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EBAG9O00559 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EBAG9O00559 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EBAG9O00559 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EBAG9O00559 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
EBAG9O00559 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EBAG9O00559 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EBAG9O00559 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EBAG9O00559 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EBAG9O00559 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EBAG9O00559 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EBAG9O00559 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EBAG9O00559 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EBAG9O00559 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EBAG9O00559 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EBAG9O00559 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EBAG9O00559 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBAG9O00559 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBAG9O00559 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBAG9O00559 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBAG9O00559 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBAG9O00559 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EBAG9O00559 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EBAG9O00559 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EBAG9O00559 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EBAG9O00559 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms