Protein–RNA interactions for Protein: O00341

SLC1A7, Excitatory amino acid transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A7O00341 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A7O00341 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A7O00341 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A7O00341 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A7O00341 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A7O00341 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A7O00341 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A7O00341 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A7O00341 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A7O00341 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A7O00341 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A7O00341 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A7O00341 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A7O00341 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A7O00341 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A7O00341 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A7O00341 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A7O00341 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A7O00341 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A7O00341 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A7O00341 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A7O00341 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms