Protein–RNA interactions for Protein: J3QT63

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QT63 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QT63 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
J3QT63 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3QT63 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3QT63 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3QT63 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3QT63 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
J3QT63 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
J3QT63 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QT63 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QT63 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
J3QT63 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QT63 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QT63 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
J3QT63 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QT63 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QT63 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QT63 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QT63 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QT63 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QT63 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QT63 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QT63 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QT63 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QT63 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QT63 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QT63 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QT63 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QT63 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QT63 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QT63 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QT63 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QT63 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QT63 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QT63 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QT63 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QT63 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QT63 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QT63 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QT63 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QT63 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QT63 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QT63 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QT63 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QT63 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QT63 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QT63 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QT63 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QT63 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QT63 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QT63 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QT63 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QT63 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QT63 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QT63 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QT63 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QT63 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QT63 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QT63 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QT63 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QT63 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QT63 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QT63 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
J3QT63 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3QT63 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3QT63 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QT63 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QT63 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QT63 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QT63 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QT63 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QT63 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QT63 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QT63 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QT63 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QT63 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QT63 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QT63 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QT63 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QT63 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QT63 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QT63 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QT63 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QT63 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QT63 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QT63 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QT63 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QT63 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QT63 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3QT63 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3QT63 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3QT63 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3QT63 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
J3QT63 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3QT63 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3QT63 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
J3QT63 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3QT63 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3QT63 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3QT63 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms