Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms